MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008340	GCC	2	6	123121	123126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319274
3002	NC_008340	GC	3	6	123222	123227	0 %	0 %	50 %	50 %	114319274
3003	NC_008340	GCG	3	9	123269	123277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319275
3004	NC_008340	GCG	2	6	123316	123321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319275
3005	NC_008340	CAG	2	6	123375	123380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319275
3006	NC_008340	CGC	2	6	123421	123426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319275
3007	NC_008340	GGTG	2	8	123438	123445	0 %	25 %	75 %	0 %	114319275
3008	NC_008340	TGG	2	6	123448	123453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319275
3009	NC_008340	GTC	2	6	123468	123473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319275
3010	NC_008340	GC	3	6	123511	123516	0 %	0 %	50 %	50 %	114319275
3011	NC_008340	CGG	2	6	123526	123531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319275
3012	NC_008340	CAG	2	6	123567	123572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319275
3013	NC_008340	GGGCA	2	10	123619	123628	20 %	0 %	60 %	20 %	114319275
3014	NC_008340	GTC	2	6	123715	123720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319275
3015	NC_008340	GGGCC	2	10	123738	123747	0 %	0 %	60 %	40 %	114319275
3016	NC_008340	GCC	2	6	123761	123766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_008340	GAG	2	6	123830	123835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_008340	CCG	2	6	123931	123936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319276
3019	NC_008340	CTG	2	6	123982	123987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319276
3020	NC_008340	CTT	2	6	124047	124052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319276
3021	NC_008340	CGA	2	6	124056	124061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319276
3022	NC_008340	CTGCAC	2	12	124114	124125	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114319276
3023	NC_008340	CTG	2	6	124128	124133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319276
3024	NC_008340	CGA	2	6	124188	124193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319276
3025	NC_008340	GGA	2	6	124212	124217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319276
3026	NC_008340	TGG	2	6	124220	124225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319276
3027	NC_008340	CCG	2	6	124254	124259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319276
3028	NC_008340	TGC	2	6	124283	124288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319276
3029	NC_008340	CGG	2	6	124293	124298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319276
3030	NC_008340	CGGG	2	8	124336	124343	0 %	0 %	75 %	25 %	114319276
3031	NC_008340	CGG	2	6	124385	124390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319276
3032	NC_008340	ACT	2	6	124404	124409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319276
3033	NC_008340	ACC	2	6	124453	124458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319276
3034	NC_008340	CCT	2	6	124539	124544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319276
3035	NC_008340	GTG	3	9	124576	124584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319276
3036	NC_008340	ACCC	2	8	124588	124595	25 %	0 %	0 %	75 %	114319276
3037	NC_008340	TCA	2	6	124604	124609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319276
3038	NC_008340	TG	3	6	124637	124642	0 %	50 %	50 %	0 %	114319276
3039	NC_008340	TCT	2	6	124747	124752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319276
3040	NC_008340	TGA	2	6	124755	124760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319276
3041	NC_008340	TGG	2	6	124811	124816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319276
3042	NC_008340	TGA	2	6	124861	124866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_008340	TGG	2	6	125072	125077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319277
3044	NC_008340	TCCGA	2	10	125117	125126	20 %	20 %	20 %	40 %	114319277
3045	NC_008340	TCA	2	6	125134	125139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319277
3046	NC_008340	GGC	2	6	125171	125176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319277
3047	NC_008340	CCT	2	6	125189	125194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319277
3048	NC_008340	GCG	2	6	125195	125200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319277
3049	NC_008340	CGT	2	6	125237	125242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319277
3050	NC_008340	GTG	2	6	125311	125316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319277
3051	NC_008340	AGA	2	6	125382	125387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319277
3052	NC_008340	GAGC	2	8	125408	125415	25 %	0 %	50 %	25 %	114319277
3053	NC_008340	T	6	6	125420	125425	0 %	100 %	0 %	0 %	114319277
3054	NC_008340	CCGAGC	2	12	125461	125472	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114319277
3055	NC_008340	GTT	2	6	125608	125613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319277
3056	NC_008340	TCG	2	6	125623	125628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319277
3057	NC_008340	GCCA	2	8	125632	125639	25 %	0 %	25 %	50 %	114319277
3058	NC_008340	TGG	2	6	125666	125671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319277
3059	NC_008340	CTA	2	6	125675	125680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319277
3060	NC_008340	CCA	2	6	125684	125689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319277
3061	NC_008340	GCCG	2	8	125774	125781	0 %	0 %	50 %	50 %	114319277
3062	NC_008340	TGT	2	6	125797	125802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319277
3063	NC_008340	GCG	2	6	125978	125983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319277
3064	NC_008340	CG	3	6	125994	125999	0 %	0 %	50 %	50 %	114319277
3065	NC_008340	ACG	2	6	126031	126036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_008340	CCGC	2	8	126058	126065	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3067	NC_008340	ATT	2	6	126395	126400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_008340	GC	3	6	126408	126413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_008340	T	6	6	126441	126446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_008340	CTTT	2	8	126470	126477	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3071	NC_008340	GTC	2	6	126514	126519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_008340	GTT	2	6	126550	126555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_008340	CCT	2	6	126664	126669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_008340	AT	4	8	126829	126836	50 %	50 %	0 %	0 %	114319278
3075	NC_008340	GAA	2	6	126862	126867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319278
3076	NC_008340	GA	4	8	126966	126973	50 %	0 %	50 %	0 %	114319278
3077	NC_008340	GCG	2	6	126977	126982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319278
3078	NC_008340	GGC	2	6	127111	127116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319278
3079	NC_008340	AGC	2	6	127144	127149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319278
3080	NC_008340	CTC	2	6	127185	127190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319278
3081	NC_008340	TCT	2	6	127207	127212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319278
3082	NC_008340	AGGT	2	8	127325	127332	25 %	25 %	50 %	0 %	114319278
3083	NC_008340	TC	3	6	127471	127476	0 %	50 %	0 %	50 %	114319278
3084	NC_008340	TCT	2	6	127483	127488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319278
3085	NC_008340	T	6	6	127492	127497	0 %	100 %	0 %	0 %	114319278
3086	NC_008340	GCC	2	6	127543	127548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319278
3087	NC_008340	TC	3	6	127585	127590	0 %	50 %	0 %	50 %	114319278
3088	NC_008340	CGTTG	2	10	127622	127631	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3089	NC_008340	TTG	2	6	127644	127649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_008340	GGT	2	6	127673	127678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_008340	A	6	6	127743	127748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_008340	T	6	6	127757	127762	0 %	100 %	0 %	0 %	114319279
3093	NC_008340	CTTT	2	8	127773	127780	0 %	75 %	0 %	25 %	114319279
3094	NC_008340	CA	3	6	127937	127942	50 %	0 %	0 %	50 %	114319279
3095	NC_008340	ATC	2	6	127982	127987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319279
3096	NC_008340	AAGT	2	8	128010	128017	50 %	25 %	25 %	0 %	114319279
3097	NC_008340	TCTG	2	8	128030	128037	0 %	50 %	25 %	25 %	114319279
3098	NC_008340	CTT	2	6	128073	128078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319279
3099	NC_008340	GA	3	6	128094	128099	50 %	0 %	50 %	0 %	114319279
3100	NC_008340	TCT	2	6	128147	128152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319279
3101	NC_008340	TCTAT	2	10	128195	128204	20 %	60 %	0 %	20 %	114319279
3102	NC_008340	A	6	6	128254	128259	100 %	0 %	0 %	0 %	114319279
3103	NC_008340	TTA	2	6	128295	128300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114319279
3104	NC_008340	TG	3	6	128310	128315	0 %	50 %	50 %	0 %	114319279
3105	NC_008340	TAC	2	6	128361	128366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319279
3106	NC_008340	TCT	2	6	128371	128376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319279
3107	NC_008340	GAA	2	6	128430	128435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319279
3108	NC_008340	CAA	2	6	128447	128452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319279
3109	NC_008340	GCC	2	6	128485	128490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319279
3110	NC_008340	T	7	7	128537	128543	0 %	100 %	0 %	0 %	114319279
3111	NC_008340	CAT	2	6	128613	128618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319279
3112	NC_008340	GAT	3	9	128623	128631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319279
3113	NC_008340	CA	3	6	128671	128676	50 %	0 %	0 %	50 %	114319279
3114	NC_008340	ATG	2	6	128714	128719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319279
3115	NC_008340	CGGT	2	8	128732	128739	0 %	25 %	50 %	25 %	114319279
3116	NC_008340	ATG	2	6	128832	128837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_008340	TGAG	2	8	128889	128896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_008340	TG	3	6	129032	129037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_008340	GCC	3	9	129060	129068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319280
3120	NC_008340	TGT	2	6	129077	129082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319280
3121	NC_008340	GCC	2	6	129116	129121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319280
3122	NC_008340	AGGT	2	8	129126	129133	25 %	25 %	50 %	0 %	114319280
3123	NC_008340	GGC	2	6	129182	129187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319280
3124	NC_008340	TCCG	2	8	129193	129200	0 %	25 %	25 %	50 %	114319280
3125	NC_008340	CGC	2	6	129214	129219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319280
3126	NC_008340	GTT	2	6	129221	129226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319280
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3130	NC_008340	TGCG	2	8	129429	129436	0 %	25 %	50 %	25 %	114319280
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3162	NC_008340	CG	3	6	130545	130550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3232	NC_008340	CGGG	2	8	134221	134228	0 %	0 %	75 %	25 %	114319282
3233	NC_008340	GCG	2	6	134329	134334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319282
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3240	NC_008340	GGC	2	6	134690	134695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319282
3241	NC_008340	TGA	2	6	134703	134708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319282
3242	NC_008340	CTG	2	6	134798	134803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319282
3243	NC_008340	CG	3	6	134806	134811	0 %	0 %	50 %	50 %	114319282
3244	NC_008340	CCATG	2	10	134830	134839	20 %	20 %	20 %	40 %	114319282
3245	NC_008340	GCC	2	6	134851	134856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319282
3246	NC_008340	G	6	6	134904	134909	0 %	0 %	100 %	0 %	114319282
3247	NC_008340	GCC	2	6	134933	134938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319282
3248	NC_008340	GGT	2	6	135020	135025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319283
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3250	NC_008340	GCA	2	6	135190	135195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319283
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3498	NC_008340	AT	3	6	145837	145842	50 %	50 %	0 %	0 %	114319290
3499	NC_008340	GGGC	2	8	145877	145884	0 %	0 %	75 %	25 %	114319290
3500	NC_008340	GGCC	2	8	145943	145950	0 %	0 %	50 %	50 %	114319290

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